原則上，中央補助款項應撥入縣公庫後，業務單位始得辦理撥付。但以下特殊情形，經簽奉核准同意縣庫代墊：
一、 依據勞動基準法進用之員工，其薪資應按月如期支付，統一由縣庫代墊。
二、 代墊及歸墊之作法：
（一） 納入預算者：請按原編歲出預算科目，簽辦先行分配支付；嗣後積極催促中央補助款撥入縣庫歸墊。
（二） 代收代付者：請各用人機關（單位）由貴管之年度預算內自行擇定相關科目簽辦墊支；嗣後積極催促中央代辦經費撥入各該專戶，再續簽辦從該專戶動撥及支出收回歸墊縣庫。
三、 業務單位簽呈內容及其他注意事項：
（一） 請業務單位於簽呈文內敘明欲墊支之計畫及原因，須支應之月份（期間），預估中央補助入庫歸墊之期程，簽會財、主單位，並奉核准後始得辦理縣庫代墊事宜。
（二） 縣庫代墊中央款項案，請業務單位持續追蹤中央補助款項入庫情形。